Unter dem Begriff Darmflora wird die Gesamtheit der im Magen-Darm-Trakt lebenden Mikroorganismen zusammengefasst. Die Mehrzahl der Mikroorganismen sind Bakterien. 

Etwa 100 Billionen Mikroorganismen aus über 500 verschiedenen Bakterienspezies leben im Magen-Darm-Trakt. Das sind etwa  zehn Mal mehr als die Anzahl aller menschlichen Körperzellen.